小马宝莉故事发生在白垩纪营地事件的六年后，“努布拉六人组”的成员们正努力在岛上找到自己的立足点，在一个充满恐龙和想要伤害它们的人的世界里航行。在一场悲剧之后重聚，这群人走到一起，却发现自己在逃跑，并陷入了一场全球冒险，以解开一个威胁到他们的世界的阴谋。